Биологические базы данных: различия между версиями

Перейти к навигации Перейти к поиску
Нет описания правки
Строка 6: Строка 6:
* Япония: [[NBDC]]
* Япония: [[NBDC]]


== Типы баз данных ==
==Типы баз данных==
 
===Библиографические и реферативные базы данных===
* [[Base]] − Сервис поиска научных публикаций
* [[ELibrary]] − Библиотека научных статей, докладов и диссертаций на русском языке
* [[Embase]] − Библиографическая база данных по биомедицинской и фармакологической литературе
* [[Google_Scholar]] − Поисковик по научным статьям
* [[Lens]] − Поиск патентов, поиск патентованных ДНК последовательностей
* [[OATD]] − Поисковик по диссертациям
* [[OpenDOAR]] − База данных репозиториев научных работ
* [[ProQuest]] − Поисковый движок по диссертациям, начиная с 1743 года и заканчивая современными
* [[PubMed]] − Поисковый портал по публикациям в биомедицинских журналах
* [[Scopus]] − База данных абстрактов статей и рефератов
* [[Web_of_Science]] − База данных абстрактов статей
 
===Базы данных последовательностей ДНК===
* [[DDBJ]] − Коллекция последовательностей нуклеотидов
* [[ENA]] − Репозиторий аннотированных ДНК и РНК последовательностей
* [[GenBank]] − Аннотированные коллекции всех публично доступных нуклеотидных последовательностей и их протеиновых транскриптов
* [[RefSeq]] − Датасет геномные, транскрипторных и аминокислотных последовательностей
 
===Базы данных последовательности белков===
* [[PIR]] − Ресурсы для помощи в интеграции протеомных и геномных данных, а также для стандартизации аннотаций белка
* [[UniProtKB]] − База данных по аминокислотным последовательностям и функционалу белков
 
===Базы данных 3D структур===
* [[CCDC]] − База данных кристаллических структур малых молекул
* [[EMDB]] − Репозиторий электронномикроскопических изображений макромолекулярных комплексов и субклеточных структур
* [[PDB]] − База трехмерных структурных данных белков и нуклеиновых кислот
 
===Базы данных химических соединений===
* [[CAS]] − База данных химических веществ
* [[CSDB]] − База данных углеводных структур, таксономий,библиографии, ЯМР данными
* [[PubChem]] − База данных структуры и активности химических структур
* [[Reaxys]] − Химический каталог выделенных соединений, фактов о них, информации о реакциях и синтезе
 
===Базы данных геномов и аннотаций===
* [[Ensembl]] − Автоматически аннотируемые базы данных для генома человека и геномов других видов
* [[NCBI_Genome]] − Геномная база данных
* [[UCSC_Genome_Browser]] − Браузер человеческого генома
 
===Базы данных вариаций генома===
* [[ClinVar]] − Агрегатор информации о генетических вариациях и их влияниях на здоровье человека
* [[DbSNP]] − База данных однонуклеотидных полиморфизмов ([[SNP]])
* [[DbVar]] − База данных геномных вариаций человека - вставок, делеций, инверсий, мобильных элементов и транслокаций
* [[OMIM]] − Каталог человеческих генов и генетических расстройств
 
===Базы данных геном-фенотип===
* [[DbGaP]] − Данные из исследований взаимосвязей генотипов и фенотипов у людей
* [[ICGC]] − Наборы данных по онкогеномике
 
===Базы данных взаимодействий===
* [[DrugBank]] − База данных, содержащая информацию о лекарствах и лекарственных мишенях
* [[Kalium]] − База данных по полипептидным лигандам калиевых каналов
* [[MINT]] − Данные о функциональных взаимодействиях белков между собой
* [[STRING]] − База данных для известных и предсказываемых белок-белковых взаимодействий
 
===Базы данных сигнальных путей===
* [[KEGG]] − Коллекция баз данных о геномах, биологических путей, болезней, лекарств и химических веществ
* [[Reactome]] − База данных биологических путей
* [[WikiPathways]] − Вики, посвященная биологическим путям
 
===Базы данных секвенирования===
* [[SRA]] − База данных высокопроизводительного секвенирования
 
===Базы данных заболеваний и меицинской информации===
* [[ClinicalTrials]] − База данных частно и публично финансируемых клинических исследованиях
* [[Pharma_Intelligence]] − Данные о мировых исследованиях и разработках (R&D) в области фармакологии
 
===Базы данных по экспрессии генов/гистологии===
* [[Expression_Atlas]] − База данных генов и белковой экспресии
* [[Human_Protein_Atlas]] − Шведская база данных максимального числа известных белков человеческого организма с распределением по клеткам, тканям и органам
 
===Базы данных по таксономии===
* [[NCBI_Taxonomy_Browser]] − База данных по таксономиям
 
===Поисковые движки по биологическим базам данных===
* [[Expasy]] − Портал для биологических баз данных и инструментов


== Журналы, публикующие обзоры по ББД ==
== Журналы, публикующие обзоры по ББД ==

Навигация