AlphaFold

Проект AlphaFold создан компанией DeepMind и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка.

AlphaFold открывает новые перспективы для белковой инженерии, так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно. Эта проблема называется фолдингом белка.

История

• Декабрь 2018, победа AlphaFold на CASP
• Ноябрь 2020, AlphaFold 2 снова побеждает на CASP

Комментарий
Необходимо описать «CASP», но как описать серию экспериментов, проходящую из года в год, в которой есть победители и проигравшие? Experimentalist

Ссылки

• Реализация Alphafold на PyTorch
• MiniFold, альтернативная реализация алгоритма AlphaFold от Eric Alcaide на TensorFlow и Keras; страница на Zenodo