AlphaFold: различия между версиями
Перейти к навигации
Перейти к поиску
Нет описания правки |
мНет описания правки |
||
| (не показано 5 промежуточных версий этого же участника) | |||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
Проект [https://deepmind.com/research/case-studies/alphafold AlphaFold] создан компанией [https://deepmind.com/ DeepMind] и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка. | Проект [https://deepmind.com/research/case-studies/alphafold AlphaFold] создан компанией [https://deepmind.com/ DeepMind] и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка. | ||
AlphaFold открывает новые перспективы для [ | AlphaFold открывает новые перспективы для [[белковая инженерия|белковой инженерии]], так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно. | ||
Эта проблема называется [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A4%D0%BE%D0%BB%D0%B4%D0%B8%D0%BD%D0%B3_%D0%B1%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%B0 фолдингом белка]. | Эта проблема называется [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A4%D0%BE%D0%BB%D0%B4%D0%B8%D0%BD%D0%B3_%D0%B1%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%B0 фолдингом белка]. | ||
== История == | |||
* Декабрь 2018, победа AlphaFold на [https://en.wikipedia.org/wiki/CASP CASP] | |||
* Ноябрь 2020, AlphaFold 2 снова побеждает на [https://en.wikipedia.org/wiki/CASP CASP] | |||
{{ | |||
Комментарий | |||
| текст=Необходимо описать «[https://predictioncenter.org/ CASP]», но как описать серию экспериментов, проходящую из года в год, в которой есть победители и проигравшие? | |||
| автор=Experimentalist | |||
}} | |||
== Ссылки == | == Ссылки == | ||
* Реализация [https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch Alphafold на PyTorch] | * Реализация [https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch Alphafold на PyTorch] | ||
* [https://github.com/hypnopump/MiniFold MiniFold], альтернативная реализация алгоритма AlphaFold от Eric Alcaide на | * [https://github.com/hypnopump/MiniFold MiniFold], альтернативная реализация алгоритма AlphaFold от Eric Alcaide на [https://www.tensorflow.org/ TensorFlow] и [https://keras.io/ Keras]; [https://zenodo.org/record/3774491 страница] на [[Zenodo]] | ||
[[Category:Белковая инженерия]] | [[Category:Белковая инженерия]] | ||
| Строка 13: | Строка 24: | ||
[[Category:Программы]] | [[Category:Программы]] | ||
[[Category:Открытое ПО]] | [[Category:Открытое ПО]] | ||
[[Category:Незавершённые статьи]] | |||
Текущая версия от 19:14, 22 февраля 2021
Проект AlphaFold создан компанией DeepMind и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка.
AlphaFold открывает новые перспективы для белковой инженерии, так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно. Эта проблема называется фолдингом белка.
История[править]
| Комментарий |
|---|
Необходимо описать «CASP», но как описать серию экспериментов, проходящую из года в год, в которой есть победители и проигравшие? |
Ссылки[править]
- Реализация Alphafold на PyTorch
- MiniFold, альтернативная реализация алгоритма AlphaFold от Eric Alcaide на TensorFlow и Keras; страница на Zenodo