Как парсить PubMed: различия между версиями

66 байт добавлено ,  16 марта 2021
Нет описания правки
 
(не показаны 2 промежуточные версии этого же участника)
Строка 1: Строка 1:
'''PubMed (Пабмед)''' − библиографическая база данных научных публикаций, в основном биологической и медицинской направленности. Более широко трактуется как совокупность всех библиографических баз данных NCBI (Национального Центра Биотех Информации), куда, наряду с собственно PubMed, входят такие базы данных как PubChem, Gene, PMC и другие.
'''PubMed (Пабмед)''' − библиографическая база данных научных публикаций, в основном биологической и медицинской направленности. Более широко трактуется как совокупность всех библиографических баз данных NCBI (Национального Центра Биотехнологической Информации), куда, наряду с собственно PubMed, входят такие базы данных как PubChem, Gene, PMC и другие.


Самая биомедиинская мякотка концентрируется в базе данных под названием «Medline». В ней ищут интерфейсы вышеназванных тематических баз данных.
Самая биомедицинская мякотка концентрируется в базе данных под названием «Medline». В ней ищут интерфейсы вышеназванных тематических баз данных.


Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что
Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что
Строка 28: Строка 28:
==Парсинг==
==Парсинг==


Автоматический поиск происходит через обычные GET запросы. Для более чем 2 запросов в секунду требуется ключ.
Автоматический поиск происходит через обычные HTTP GET запросы. Для более чем 2 запросов в секунду требуется ключ.


Получение информации о публикации происходит в два этапа.
Получение информации о публикации происходит в два этапа.
# Вначале получают список id статей, удовлетворяющих критериям поиска (совпадение с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
# Вначале получают список идентификаторов статей (PMID), удовлетворяющих критериям поиска (совпадение с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
# По известной id статьи отправляют второй запрос на выдачу информации об этой статье. В ответ, сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)|формате Medline]]
# По известной id статьи отправляют второй запрос на выдачу информации об этой статье. В ответ, сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)|формате Medline]]


==Ссылки==
==Ссылки==
<references />
<references />