Обсуждение:Увеличение гемоглобина с возрастом: различия между версиями

Материал из hpluswiki
Перейти к навигации Перейти к поиску
Нет описания правки
 
(не показано 8 промежуточных версий этого же участника)
Строка 1: Строка 1:
Вопрос А.Алексееву:  
Вопросы А.Алексееву по докладу [http://msu-web.tech/alex3/aging/metabolomics/impress.js/examples/classic-slides_my/#/step-1 Корреляционный анализ среднепопуляционных трендов метаболитов в крови человека при старении по данным NHANES]


Смотрите, что нашла у Дениса Ширшова сегодня в его таблице по генам из пабмеда связанных со старением {{abbr|[ALAS1] 1 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.37) (ALAS-H) (5-aminolevulinic acid synthase 1) (Delta-ALA synthase 1) (Delta-aminolevulinate synthase 1) [ALAS3] [ALASH] [OK/SW-cl.121]|[[ALAS1]]}}
==Вопрос об увеличение концентрации гемоглобина с возрастом==


Дельта-аминолевулинатсинтаза катализирует конденсацию глицина с сукцинил-КоА с образованием дельта-аминолевулиновой кислоты . Этот кодируемый ядром митохондриальный фермент является первым и ограничивающим скорость ферментом в пути биосинтеза гема у млекопитающих. Существует 2 тканеспецифичных изофермента: домашний фермент, кодируемый геном ALAS1, и тканеспецифический фермент эритроидного происхождения, кодируемый ALAS2 . [6]
Смотрите, что нашла у Дениса Ширшова сегодня в его таблице по генам из пабмеда связанных со старением {{abbr|[[ALAS1]] 1 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.37) (ALAS-H) (5-aminolevulinic acid synthase 1) (Delta-ALA synthase 1) (Delta-aminolevulinate synthase 1) [ALAS3] [ALASH] [OK/SW-cl.121]|ALAS1}}


Мыши, лишенные этого гена, демонстрируют эмбриональную эмбриональную летальность, что указывает на то, что ALAS важен для раннего эмбриогенеза. <ref>Скасса М.Э., Губерман А.С., Церути Дж.М., Канепа Э.Т. (2004). «Ядерный фактор 3 печени и ядерный фактор 1 регулируют экспрессию гена 5-аминолевулинатсинтазы и участвуют в репрессии инсулина» . J. Biol. Chem . 279 (27): 28082–92. DOI : 10.1074 / jbc.M401792200 . PMID 15123725.</ref> <ref>Дуайер Б.Э., Смит М.А., Ричардсон С.Л. и др. (2009). «Снижение регуляции аминолевулинат-синтазы, фермента, ограничивающего скорость биосинтеза гема при болезни Альцгеймера»</ref>
Дельта-аминолевулинатсинтаза катализирует конденсацию глицина с сукцинил-КоА с образованием дельта-аминолевулиновой кислоты . Этот кодируемый ядром митохондриальный фермент является первым и ограничивающим скорость ферментом в пути биосинтеза гема у млекопитающих. Существует 2 тканеспецифичных изофермента: домашний фермент, кодируемый геном ALAS1, и тканеспецифический фермент эритроидного происхождения, кодируемый ALAS2. <ref>Скасса М.Э., Губерман А.С., Церути Дж.М., Канепа Э.Т. (2004). «Ядерный фактор 3 печени и ядерный фактор 1 регулируют экспрессию гена 5-аминолевулинатсинтазы и участвуют в репрессии инсулина» . J. Biol. Chem . 279 (27): 28082–92. DOI : 10.1074 / jbc.M401792200 . PMID 15123725.</ref>


А теперь смотрите ваш график по гемоглобину на фейсбуке. Изменение скорости синтеза гема может быть одной из вероятностных причин
Мыши, лишенные этого гена, демонстрируют эмбриональную летальность, что указывает на то, что ALAS важен для раннего эмбриогенеза. <ref>Дуайер Б.Э., Смит М.А., Ричардсон С.Л. и др. (2009). «Снижение регуляции аминолевулинат-синтазы, фермента, ограничивающего скорость биосинтеза гема при болезни Альцгеймера»</ref>
Альцгеймер и репрессия инсулина указывают на возрастозависимый вариант экспрессии гена, участвующего в синтезе гема)
 
А теперь смотрите ваш график по гемоглобину на фейсбуке. Изменение скорости синтеза гема может быть одной из вероятностных причин. Альцгеймер и репрессия инсулина указывают на возрастозависимый вариант экспрессии гена, участвующего в синтезе гема. Может быть еще и влияние HIF1A, фактора индуцирующего гипоксию, он тоже есть в таблице


На графике гемоглобин увеличивается с возрастом? Интересно как считали концентрацию гемоглобина. С возрастом чаще развиваются железодефицитные анемии.
На графике гемоглобин увеличивается с возрастом? Интересно как считали концентрацию гемоглобина. С возрастом чаще развиваются железодефицитные анемии.
Но может у них была другая какая то методика подсчета
Но может у них была другая какая то методика подсчета


Может быть еще и влияние HIF, фактора индуцирующего гипоксию, он тоже был в таблице
<references />
HIF1A
 
==Вопрос об увеличение концентрации гемоглобина с возрастом 2==
К какому результату по гемоглобину привел анализ возрастной динамики метаболитов в вашей работе? Увеличивается ли гемоглобин с возрастом?
 
Если удалось трактовать графики правильно, то концентрация гемоглобина с возрастом увеличивается. {{abbr|Про метод расчета концентраций спросить вторым темпом|Как это можно было бы увязать с фактом развития}} железодефицитных анемий с возрастом?
 
Еще одним доводом к тому, что концентрация гемоглобина с возрастом должна снижаться, является снижение экспрессии гена ALAS1 <ref>Дуайер Б.Э., Смит М.А., Ричардсон С.Л. и др. (2009). «Снижение регуляции аминолевулинат-синтазы, фермента, ограничивающего скорость биосинтеза гема при болезни Альцгеймера»</ref>. При этом известно, что фермент, кодируемый данным геном является первым и ограничивающим скорость ферментом в пути биосинтеза гема у млекопитающих <ref>Скасса М.Э., Губерман А.С., Церути Дж.М., Канепа Э.Т. (2004). «Ядерный фактор 3 печени и ядерный фактор 1 регулируют экспрессию гена 5-аминолевулинатсинтазы и участвуют в репрессии инсулина» . J. Biol. Chem . 279 (27): 28082–92. DOI : 10.1074 / jbc.M401792200 . PMID 15123725.</ref>
  Дельта-аминолевулинатсинтаза ограничивает скорость биосинтеза гема, т.е. является ингибитором. Следовательно снижение экспрессии ALAS1 приводит к снижению концентрации ингибитора, а следовательно приводит к ускорению реакций биосинтеза гема и концентрация гемоглобина увеличивается (с возрастом). А не уменьшается. А как на графике? [[Участник:Denis.s|Denis.s]] ([[Обсуждение участника:Denis.s|обсуждение]])
 
<s>Что автор может сказать в свое оправдание?</s>
 
==Предложение об упорядочивании графиков по метаболическим переходам==
Интересной идеей представляется упорядочивание большого количества итоговых графиков по метаболическим переходам, содержащихся в работе. Например, можно попробовать сформировать на их основе метаболические сети по возрастным периодам с указанием основных биохимических путей в которых они участвуют.


<references />
Как сам автор оценил бы перспективы работы в данном направлении?

Текущая версия от 18:18, 8 мая 2021

Вопросы А.Алексееву по докладу Корреляционный анализ среднепопуляционных трендов метаболитов в крови человека при старении по данным NHANES

Вопрос об увеличение концентрации гемоглобина с возрастом[править]

Смотрите, что нашла у Дениса Ширшова сегодня в его таблице по генам из пабмеда связанных со старением ALAS1

Дельта-аминолевулинатсинтаза катализирует конденсацию глицина с сукцинил-КоА с образованием дельта-аминолевулиновой кислоты . Этот кодируемый ядром митохондриальный фермент является первым и ограничивающим скорость ферментом в пути биосинтеза гема у млекопитающих. Существует 2 тканеспецифичных изофермента: домашний фермент, кодируемый геном ALAS1, и тканеспецифический фермент эритроидного происхождения, кодируемый ALAS2. [1]

Мыши, лишенные этого гена, демонстрируют эмбриональную летальность, что указывает на то, что ALAS важен для раннего эмбриогенеза. [2]

А теперь смотрите ваш график по гемоглобину на фейсбуке. Изменение скорости синтеза гема может быть одной из вероятностных причин. Альцгеймер и репрессия инсулина указывают на возрастозависимый вариант экспрессии гена, участвующего в синтезе гема. Может быть еще и влияние HIF1A, фактора индуцирующего гипоксию, он тоже есть в таблице

На графике гемоглобин увеличивается с возрастом? Интересно как считали концентрацию гемоглобина. С возрастом чаще развиваются железодефицитные анемии. Но может у них была другая какая то методика подсчета

  1. ↑ Скасса М.Э., Губерман А.С., Церути Дж.М., Канепа Э.Т. (2004). «Ядерный фактор 3 печени и ядерный фактор 1 регулируют экспрессию гена 5-аминолевулинатсинтазы и участвуют в репрессии инсулина» . J. Biol. Chem . 279 (27): 28082–92. DOI : 10.1074 / jbc.M401792200 . PMID 15123725.
  2. ↑ Дуайер Б.Э., Смит М.А., Ричардсон С.Л. и др. (2009). «Снижение регуляции аминолевулинат-синтазы, фермента, ограничивающего скорость биосинтеза гема при болезни Альцгеймера»

Вопрос об увеличение концентрации гемоглобина с возрастом 2[править]

К какому результату по гемоглобину привел анализ возрастной динамики метаболитов в вашей работе? Увеличивается ли гемоглобин с возрастом?

Если удалось трактовать графики правильно, то концентрация гемоглобина с возрастом увеличивается. Как это можно было бы увязать с фактом развития железодефицитных анемий с возрастом?

Еще одним доводом к тому, что концентрация гемоглобина с возрастом должна снижаться, является снижение экспрессии гена ALAS1 [1]. При этом известно, что фермент, кодируемый данным геном является первым и ограничивающим скорость ферментом в пути биосинтеза гема у млекопитающих [2] 

 Дельта-аминолевулинатсинтаза ограничивает скорость биосинтеза гема, т.е. является ингибитором. Следовательно снижение экспрессии ALAS1 приводит к снижению концентрации ингибитора, а следовательно приводит к ускорению реакций биосинтеза гема и концентрация гемоглобина увеличивается (с возрастом). А не уменьшается. А как на графике? Denis.s (обсуждение)

Что автор может сказать в свое оправдание?

Предложение об упорядочивании графиков по метаболическим переходам[править]

Интересной идеей представляется упорядочивание большого количества итоговых графиков по метаболическим переходам, содержащихся в работе. Например, можно попробовать сформировать на их основе метаболические сети по возрастным периодам с указанием основных биохимических путей в которых они участвуют.

Как сам автор оценил бы перспективы работы в данном направлении?

  1. ↑ Дуайер Б.Э., Смит М.А., Ричардсон С.Л. и др. (2009). «Снижение регуляции аминолевулинат-синтазы, фермента, ограничивающего скорость биосинтеза гема при болезни Альцгеймера»
  2. ↑ Скасса М.Э., Губерман А.С., Церути Дж.М., Канепа Э.Т. (2004). «Ядерный фактор 3 печени и ядерный фактор 1 регулируют экспрессию гена 5-аминолевулинатсинтазы и участвуют в репрессии инсулина» . J. Biol. Chem . 279 (27): 28082–92. DOI : 10.1074 / jbc.M401792200 . PMID 15123725.
Источник — https://transhumanist.ru/index.php?title=Обсуждение:Увеличение_гемоглобина_с_возрастом&oldid=4914