Источники открытых данных: различия между версиями

Текущая версия от 22:53, 27 февраля 2021

Эта страница существует для того, чтобы собрать информацию об источниках открытых данных, которые могут пригодиться в дальнейших исследованиях. Также я предлагаю собирать здесь и интересные Wiki-проекты, на которые имеет смысл заглянуть.

Wiki[править]

Scholarpedia — громадная энциклопедия с информацией о работе мозга, ощущений и так далее.

Encyclopatia — «энциклопедия по медицинским штукам», например «расстрельный список препаратов». Для нас может быть полезна заметками о медицине в России, информацией о некачественных препаратах и так далее.

Открытые данные[править]

Коннектом[править]

Connectome Coordination Facility

Human Connectome Project, USC University of Southern California.

Генетика, молекулярная биология, и т.д.[править]

ENCODE project — Энциклопедия ДНК элементов. Содержит аннотации человеческого генома и транскриптома.^[1]^[2]^[3]

GitHub, Mikhail Dozmorov — Brain-related —omics data — открытые данные по геномике (genomics), транскриптомике (transcriptomics), эпигеномике (epigenomics), и всему, что сводится к термину «-omics data» и теме мозга. Эти данные в основном получены для Homo Sapiens, хотя автор не отказывается добавить в подборку другие модельные организмы.

GitHub, Mikhail Dozmorov — HiC_data — открытые данные для исследования трёхмерной организации хроматина (chromosome conformation capture).

↑ Livescience - What Is ENCODE, and Why Does It Matter?
↑ 8.2% of the Human Genome Is Constrained: Variation in Rates of Turnover across Functional Element Classes in the Human Lineage, Chris M. Rands, Stephen Meader, Chris P. Ponting, Gerton Lunter
↑ Livescience — People Use Just 8.2% of Their DNA, Study Finds

[1] Livescience - What Is ENCODE, and Why Does It Matter?

[2] 8.2% of the Human Genome Is Constrained: Variation in Rates of Turnover across Functional Element Classes in the Human Lineage, Chris M. Rands, Stephen Meader, Chris P. Ponting, Gerton Lunter

[3] Livescience — People Use Just 8.2% of Their DNA, Study Finds

[1]

[2]

[3]

@@ Строка 6: / Строка 6: @@
 [http://www.scholarpedia.org/article/Main_Page Scholarpedia] — громадная энциклопедия с информацией о работе мозга, ощущений и так далее.
-[https://encyclopatia.ru/wiki/Welcome Encyclopatia] — «энциклопедия по медицинским штукам», например «[https://encyclopatia.ru/wiki/Расстрельный_список_препаратов расстрельный список препаратов]». Для нас может быть полезна заметками о медицине в России, информацией о некачественных препаратах и так далее.
+[https://encyclopatia.ru/wiki/Welcome Encyclopatia] — «энциклопедия по медицинским штукам», например «[https://encyclopatia.ru/wiki/Расстрельный_список_препаратов расстрельный список препаратов]». Для нас может быть полезна заметками о [[медицине]] в России, информацией о некачественных препаратах и так далее.
-== Открытые данные ==
+== [[Открытые данные]] ==
-=== Коннектом ===
+=== [[Коннектом]] ===
 [https://www.humanconnectome.org/ Connectome Coordination Facility]
-[http://www.humanconnectomeproject.org/ Human Connectome Project], USC University of Southern California.
+[http://www.humanconnectomeproject.org/ Human Connectome Project], [[USC University of Southern California]].
 === Генетика, молекулярная биология, и т.д. ===
-[https://www.encodeproject.org/ ENCODE] project — Encyclopedia of DNA Elements.<ref>Livescience - [https://www.livescience.com/22990-encode-explanation-facts.html What Is ENCODE, and Why Does It Matter?]</ref><ref>[https://journals.plos.org/plosgenetics/article/info:doi/10.1371/journal.pgen.1004525 8.2% of the Human Genome Is Constrained: Variation in Rates of Turnover across Functional Element Classes in the Human Lineage]</ref><ref>[http://livescience.com/46986-human-genome-junk-dna.html People Use Just 8.2% of Their DNA, Study Finds]</ref>
+[https://www.encodeproject.org/ ENCODE] project — Энциклопедия ДНК элементов. Содержит аннотации человеческого генома и транскриптома.<ref>Livescience - [https://www.livescience.com/22990-encode-explanation-facts.html What Is ENCODE, and Why Does It Matter?]</ref><ref>[https://journals.plos.org/plosgenetics/article/info:doi/10.1371/journal.pgen.1004525 8.2% of the Human Genome Is Constrained: Variation in Rates of Turnover across Functional Element Classes in the Human Lineage], Chris M. Rands, Stephen Meader, Chris P. Ponting, Gerton Lunter</ref><ref>Livescience — [http://livescience.com/46986-human-genome-junk-dna.html People Use Just 8.2% of Their DNA, Study Finds]</ref>
-[https://github.com/ GitHub], [https://dozmorovlab.github.io/ Mikhail Dozmorov] — [https://github.com/mdozmorov/Brain_genomic_data Brain-related —omics data] — открытые данные по геномике ([https://en.wikipedia.org/wiki/Genomics genomics]), транскриптомике ([https://en.wikipedia.org/wiki/Transcriptomics_technologies transcriptomics]), эпигеномике ([https://en.wikipedia.org/wiki/Epigenomics epigenomics]), и всему, что сводится к термину «-omics data» и теме мозга.
+[https://github.com/ GitHub], [https://dozmorovlab.github.io/ Mikhail Dozmorov] — [https://github.com/mdozmorov/Brain_genomic_data Brain-related —omics data] — открытые данные по [[Геномика|геномике]] ([https://en.wikipedia.org/wiki/Genomics genomics]), [[Транскриптомика|транскриптомике]] ([https://en.wikipedia.org/wiki/Transcriptomics_technologies transcriptomics]), [[Эпигеномика|эпигеномике]] ([https://en.wikipedia.org/wiki/Epigenomics epigenomics]), и всему, что сводится к термину «-omics data» и теме [[Мозг|мозга]].
-Эти данные в основном получены для Homo Sapiens, хотя автор не отказывается добавить в подборку другие модельные организмы.
+Эти данные в основном получены для [[Homo Sapiens]], хотя автор не отказывается добавить в подборку другие [[модельные организмы]].
 [https://github.com/ GitHub], [https://dozmorovlab.github.io/ Mikhail Dozmorov] — [https://github.com/mdozmorov/HiC_data HiC_data] — открытые данные для исследования трёхмерной организации хроматина ([https://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_conformation_capture chromosome conformation capture]).