Преобразование Системной схемы старения человека в граф знаний: различия между версиями

 
(не показаны 3 промежуточные версии этого же участника)
Строка 62: Строка 62:
Запуск кода чтения и преобразования CSV в Tabtree, а затем в RDF/Turtle производился просто из линукс-консоли c загруженной REPL-сессией Clojure проекта.
Запуск кода чтения и преобразования CSV в Tabtree, а затем в RDF/Turtle производился просто из линукс-консоли c загруженной REPL-сессией Clojure проекта.


`(build-hasd)` *– головная функция, которая производит все действия по созданию RDF/Turtle файла через вызов других функций. Создана специально для удобства вызова из REPL сессии.*
'''(build-hasd)''' – головная функция, которая производит все действия по созданию RDF/Turtle файла через вызов других функций. Создана специально для удобства вызова из REPL сессии.


=== Расширение СССЧ ===
=== Расширение СССЧ ===
Строка 71: Строка 71:


* классификация по системам организма
* классификация по системам организма
* классификация по отношению к девяти ключевым процессам старения согласно [статье Дарьи Халтуриной и соавторов](https://doi.org/10.1016/j.mad.2020.111230)
* классификация по отношению к девяти ключевым процессам старения согласно [https://doi.org/10.1016/j.mad.2020.111230 статье Дарьи Халтуриной и соавторов]
* классификация по уровню системы, на которой мы можем локализовать патологический процесс.
* классификация по уровню системы, на которой мы можем локализовать патологический процесс.


Строка 80: Строка 80:
==== WebProtege ====
==== WebProtege ====


Получившийся файл Turtle, в котором хранится граф знаний Схемы старения можно загрузить в онлайн-редактор онтологий [WebProtege](https://webprotege.stanford.edu/#projects/513cd457-cf09-42e3-a3b6-3b4c1cdd1ad3/edit/Classes).
Получившийся файл Turtle, в котором хранится граф знаний Схемы старения можно загрузить в онлайн-редактор онтологий [[WebProtege]] ([https://webprotege.stanford.edu/#projects/513cd457-cf09-42e3-a3b6-3b4c1cdd1ad3/edit/Classes Граф знаний в WebProtege])


Данный редактор способен отображать списки элементов графа и классы онтологии, и даже показывать графически части графа знаний, как видно ниже на скриншоте.
Данный редактор способен отображать списки элементов графа и классы онтологии, и даже показывать графически части графа знаний, как видно ниже на скриншоте.