MEDLINE (формат данных): различия между версиями
Перейти к навигации
Перейти к поиску
Denis.s (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
Denis.s (обсуждение | вклад) (→Пример) |
||
(не показаны 3 промежуточные версии этого же участника) | |||
Строка 4: | Строка 4: | ||
==Пример== | ==Пример== | ||
Выдача результата поиска по индексу [https://api.ncbi.nlm.nih.gov/lit/ctxp/v1/pubmed/?format=medline&id=28012456 28012456] | Поиск триггерных слов (например название гена) можно проводить по полям | ||
* AB − Текст абстракта статьи | |||
* MH − Термины тезауруса [https://meshb.nlm.nih.gov/search MeSH]. Например [https://meshb.nlm.nih.gov/record/ui?ui=D000375 Aging], [https://meshb.nlm.nih.gov/record/ui?ui=D017209 Apoptosis] | |||
Выдача результата поиска по индексу [https://api.ncbi.nlm.nih.gov/lit/ctxp/v1/pubmed/?format=medline&id=28012456 28012456] ([[Получение id статей на PubMed|Как получить сам id статей, содержащих нужные ключевые слова?]]) | |||
<pre> | <pre> | ||
Строка 91: | Строка 95: | ||
[https://github.com/prozion/biomed_world/blob/master/formats/medline.tree Описание полей] | [https://github.com/prozion/biomed_world/blob/master/formats/medline.tree Описание полей] | ||
[[Category:Форматы данных]] |
Текущая версия от 19:05, 15 марта 2021
MEDLINE − формат для предоставления данных из базы данных публикаций MEDLINE.
Используется при выдаче результатов поиска по PubMed API
Пример[править]
Поиск триггерных слов (например название гена) можно проводить по полям
Выдача результата поиска по индексу 28012456 (Как получить сам id статей, содержащих нужные ключевые слова?)
PMID- 28012456 OWN - NLM STAT- MEDLINE DCOM- 20171221 LR - 20190108 IS - 1532-3102 (Electronic) IS - 0143-4004 (Linking) VI - 49 DP - 2017 Jan TI - Comparative phenotypic transcriptional characterization of human full-term placenta-derived mesenchymal stromal cells compared to bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after differentiation in myogenic medium. PG - 64-67 LID - S0143-4004(16)30636-1 [pii] LID - 10.1016/j.placenta.2016.11.007 [doi] AB - Placenta-derived mesenchymal stromal cells (pMSCs) are a very attractive source of MSCs. In this short report we evaluated the expression of phenotypic markers from fetal and maternal pMSCs after exposure to myogenic medium commonly used to differentiate bone marrow MSCs (bmMSCs) to smooth muscle-like cells (SMCs). In order to reveal differences between these different MSC sources, cells were expanded and differentiated to elucidate whether this differentiation protocol facilitated efficient differentiation of SMCs from human pMSCs. We report that TGF-β1, PDGF and ascorbic acid is not sufficient to produce SMCs from pMSCs. CI - Copyright © 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved. FAU - Hart, Melanie L AU - Hart ML AD - University of Freiburg, Department of Orthopedics and Trauma Surgery, Germany; Clinical Research Group KFO 273, Department of Urology, University of Tübingen, Germany. Electronic address: melaniehar@gmail.com. FAU - Kaupp, Marvin AU - Kaupp M AD - Clinical Research Group KFO 273, Department of Urology, University of Tübingen, Germany. FAU - Brun, Juliane AU - Brun J AD - Clinical Research Group KFO 273, Department of Urology, University of Tübingen, Germany. FAU - Aicher, Wilhelm K AU - Aicher WK AD - Clinical Research Group KFO 273, Department of Urology, University of Tübingen, Germany. LA - eng PT - Journal Article DEP - 20161116 PL - Netherlands TA - Placenta JT - Placenta JID - 8006349 RN - 0 (Culture Media) SB - IM MH - Bone Marrow Cells/cytology/*metabolism MH - Cell Differentiation/*physiology MH - Culture Media MH - Female MH - Humans MH - Mesenchymal Stem Cells/cytology/*metabolism MH - Muscle Development/*physiology MH - Placenta/cytology/*metabolism MH - Pregnancy MH - Transcription, Genetic OTO - NOTNLM OT - *Bone marrow OT - *Fetal OT - *Maternal OT - *Mesenchymal stromal cells OT - *Myogenic differentiation OT - *Placenta OT - *Smooth muscle EDAT- 2016/12/26 06:00 MHDA- 2017/12/22 06:00 CRDT- 2016/12/26 06:00 PHST- 2016/07/21 00:00 [received] PHST- 2016/10/25 00:00 [revised] PHST- 2016/11/15 00:00 [accepted] PHST- 2016/12/26 06:00 [entrez] PHST- 2016/12/26 06:00 [pubmed] PHST- 2017/12/22 06:00 [medline] AID - S0143-4004(16)30636-1 [pii] AID - 10.1016/j.placenta.2016.11.007 [doi] PST - ppublish SO - Placenta. 2017 Jan;49:64-67. doi: 10.1016/j.placenta.2016.11.007. Epub 2016 Nov 16.