Как парсить PubMed - История изменений

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:56:09Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:56, 16 марта 2021
Строка 31:		Строка 31:

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.
	# Вначале получают список id статей, удовлетворяющих критериям поиска (совпадение с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]		# Вначале получают список идентификаторов статей (PMID), удовлетворяющих критериям поиска (совпадение с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
	# По известной id статьи отправляют второй запрос на выдачу информации об этой статье. В ответ, сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]		# По известной id статьи отправляют второй запрос на выдачу информации об этой статье. В ответ, сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]

	==Ссылки==		==Ссылки==
	<references />		<references />

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:43:28Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:43, 16 марта 2021
Строка 28:		Строка 28:
	==Парсинг==		==Парсинг==

	Автоматический поиск происходит через обычные GET запросы. Для более чем 2 запросов в секунду требуется ключ.		Автоматический поиск происходит через обычные HTTP GET запросы. Для более чем 2 запросов в секунду требуется ключ.

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.

Denis.s в 07:42, 16 марта 2021

2021-03-16T07:42:30Z

← Предыдущая версия		Версия от 10:42, 16 марта 2021
Строка 1:		Строка 1:
	'''PubMed (Пабмед)''' − библиографическая база данных научных публикаций, в основном биологической и медицинской направленности. Более широко трактуется как совокупность всех библиографических баз данных NCBI (Национального Центра ~~Биотех~~ Информации), куда, наряду с собственно PubMed, входят такие базы данных как PubChem, Gene, PMC и другие.		'''PubMed (Пабмед)''' − библиографическая база данных научных публикаций, в основном биологической и медицинской направленности. Более широко трактуется как совокупность всех библиографических баз данных NCBI (Национального Центра Биотехнологической Информации), куда, наряду с собственно PubMed, входят такие базы данных как PubChem, Gene, PMC и другие.

	Самая ~~биомедиинская~~ мякотка концентрируется в базе данных под названием «Medline». В ней ищут интерфейсы вышеназванных тематических баз данных.		Самая биомедицинская мякотка концентрируется в базе данных под названием «Medline». В ней ищут интерфейсы вышеназванных тематических баз данных.

	Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что		Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что

Denis.s в 07:39, 16 марта 2021

2021-03-16T07:39:57Z

← Предыдущая версия		Версия от 10:39, 16 марта 2021
Строка 4:		Строка 4:

	Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что		Почему есть Medline и есть куча других баз данных? Потому что
	* У каждой тематической базы данных есть свой специфический интерфейс заточенный под предметную область		* У каждой тематической базы данных есть свой специфический интерфейс, заточенный под ее предметную область
	* Наряду с Medline они {{abbr\|норвежский русский aka рюссеношк: от норвежского å søke, искать. Удобное слово\|сёкают}} по дополнительным каталогам, которые содержат инфу по статьям, ~~по тем или иным причинам~~ не попавшим в Medline (неопубликованные, не биомед тематики и т.д. <ref>https://www.nlm.nih.gov/bsd/difference.html</ref>).		* Наряду с Medline они также {{abbr\|норвежский русский aka рюссеношк: от норвежского å søke, искать. Удобное слово\|сёкают}} по дополнительным каталогам, которые содержат инфу по статьям, не попавшим в Medline (неопубликованные, не биомед тематики и т.д. <ref>https://www.nlm.nih.gov/bsd/difference.html</ref>).

	{\|class="wikitable"		{\|class="wikitable"

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:34:54Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:34, 16 марта 2021
Строка 31:		Строка 31:

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.
	# Вначале получают список id статей, удовлетворяющих критериям поиска (~~совпадением~~ с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]		# Вначале получают список id статей, удовлетворяющих критериям поиска (совпадение с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
	# По известной id статьи ~~шлют~~ второй запрос на выдачу информации об этой статье. ~~Сервер~~ присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]		# По известной id статьи отправляют второй запрос на выдачу информации об этой статье. В ответ, сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]

	==Ссылки==		==Ссылки==
	<references />		<references />

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:34:12Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:34, 16 марта 2021
Строка 31:		Строка 31:

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.
	# Вначале получают список id статей, ~~удовлетворяющим~~ критериям поиска (совпадением с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]		# Вначале получают список id статей, удовлетворяющих критериям поиска (совпадением с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
	# По известной id статьи шлют второй запрос на выдачу информации об этой статье. Сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]		# По известной id статьи шлют второй запрос на выдачу информации об этой статье. Сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]

	==Ссылки==		==Ссылки==
	<references />		<references />

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:33:59Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:33, 16 марта 2021
Строка 31:		Строка 31:

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.
	# Вначале получают список статей, удовлетворяющим критериям поиска (совпадением с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]		# Вначале получают список id статей, удовлетворяющим критериям поиска (совпадением с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
	# По известной id статьи шлют второй запрос на выдачу информации об этой статье. Сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]		# По известной id статьи шлют второй запрос на выдачу информации об этой статье. Сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]

	==Ссылки==		==Ссылки==
	<references />		<references />

Denis.s: /* Парсинг */

2021-03-16T07:33:43Z

Парсинг

← Предыдущая версия		Версия от 10:33, 16 марта 2021
Строка 28:		Строка 28:
	==Парсинг==		==Парсинг==

	Автоматический поиск происходит через обычные GET запросы. Для более 2 запросов в секунду требуется ключ.		Автоматический поиск происходит через обычные GET запросы. Для более чем 2 запросов в секунду требуется ключ.

	Получение информации о публикации происходит в два этапа.		Получение информации о публикации происходит в два этапа.

Denis.s в 07:33, 16 марта 2021

2021-03-16T07:33:24Z

← Предыдущая версия		Версия от 10:33, 16 марта 2021
Строка 26:		Строка 26:
	Пабмед использует поисковый движок под названием Entrez.		Пабмед использует поисковый движок под названием Entrez.

	==~~Поиск публикаций~~==		==Парсинг==

	~~===Поиск вручную===~~		Автоматический поиск происходит через обычные GET запросы. Для более 2 запросов в секунду требуется ключ.
	~~Искать статьи на Пабмеде можно вручную,~~ через ~~[https://www~~.~~ncbi~~.~~nlm.nih.gov поисковую строку на сайте NCBI]~~

	~~===Автоматизированный поиск===~~		Получение информации о публикации происходит в два этапа.
			# Вначале получают список статей, удовлетворяющим критериям поиска (совпадением с ключевыми словами в указанных частях). Подробнее: [[Получение id статей на PubMed]]
			# По известной id статьи шлют второй запрос на выдачу информации об этой статье. Сервер присылает данные в [[MEDLINE_(формат_данных)\|формате Medline]]

	==Ссылки==		==Ссылки==
	<references />		<references />

Denis.s в 07:26, 16 марта 2021

2021-03-16T07:26:21Z

← Предыдущая версия		Версия от 10:26, 16 марта 2021
Строка 6:		Строка 6:
	* У каждой тематической базы данных есть свой специфический интерфейс заточенный под предметную область		* У каждой тематической базы данных есть свой специфический интерфейс заточенный под предметную область
	* Наряду с Medline они {{abbr\|норвежский русский aka рюссеношк: от норвежского å søke, искать. Удобное слово\|сёкают}} по дополнительным каталогам, которые содержат инфу по статьям, по тем или иным причинам не попавшим в Medline (неопубликованные, не биомед тематики и т.д. <ref>https://www.nlm.nih.gov/bsd/difference.html</ref>).		* Наряду с Medline они {{abbr\|норвежский русский aka рюссеношк: от норвежского å søke, искать. Удобное слово\|сёкают}} по дополнительным каталогам, которые содержат инфу по статьям, по тем или иным причинам не попавшим в Medline (неопубликованные, не биомед тематики и т.д. <ref>https://www.nlm.nih.gov/bsd/difference.html</ref>).

	~~Пабмед использует поисковый движок под названием Entrez.~~

	{\|class="wikitable"		{\|class="wikitable"
Строка 18:		Строка 16:
	\|PubMed Central (PMC)\|\|более 5.2 млн. записей		\|PubMed Central (PMC)\|\|более 5.2 млн. записей
	\|}		\|}

			==Адреса==

	* [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ pubmed.ncbi.nlm.nih.gov − Пабмед аз из]		* [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ pubmed.ncbi.nlm.nih.gov − Пабмед аз из]
	* [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/advanced/ Расширенный поиск]		* [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/advanced/ Расширенный поиск Пабмеда]
	* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Еще более расширенный поиск]		* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Еще более расширенный поиск NCBI]

			==Entrez==
			Пабмед использует поисковый движок под названием Entrez.

	==Поиск публикаций==		==Поиск публикаций==