Текущая версия |
Ваш текст |
Строка 5: |
Строка 5: |
| * Европа: [[EMBL-EBI]] | | * Европа: [[EMBL-EBI]] |
| * Япония: [[NBDC]] | | * Япония: [[NBDC]] |
|
| |
| ==Типы баз данных==
| |
|
| |
| ===Библиографические и реферативные базы данных===
| |
| * [[Base]] [http://base-search.net] − Сервис поиска научных публикаций
| |
| * [[ELibrary]] [http://elibrary.ru] − Библиотека научных статей, докладов и диссертаций на русском языке
| |
| * [[Embase]] [http://elsevier.com/solutions/embase-biomedical-research] − Библиографическая база данных по биомедицинской и фармакологической литературе
| |
| * [[Google_Scholar]] [http://scholar.google.com] − Поисковик по научным статьям
| |
| * [[Lens]] [http://lens.org/lens/biological_search] − Поиск патентов, поиск патентованных ДНК последовательностей
| |
| * [[OATD]] [http://oatd.org] − Поисковик по диссертациям
| |
| * [[OpenDOAR]] [http://v2.sherpa.ac.uk/opendoar/search.html] − База данных репозиториев научных работ
| |
| * [[ProQuest]] [http://proquest.com] − Поисковый движок по диссертациям, начиная с 1743 года и заканчивая современными
| |
| * [[PubMed]] [http://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov] − Поисковый портал по публикациям в биомедицинских журналах
| |
| * [[Scopus]] [http://scopus.com] − База данных абстрактов статей и рефератов
| |
| * [[Web_of_Science]] [http://sclarivate.com/webofsciencegroup/solutions/web-of-science] − База данных абстрактов статей
| |
|
| |
| ===Базы данных последовательностей ДНК===
| |
| * [[DDBJ]] [http://ddbj.nig.ac.jp] − Коллекция последовательностей нуклеотидов
| |
| * [[ENA]] [http://ebi.ac.uk/ena/browser] − Репозиторий аннотированных ДНК и РНК последовательностей
| |
| * [[GenBank]] [http://ncbi.nlm.nih.gov] − Аннотированные коллекции всех публично доступных нуклеотидных последовательностей и их протеиновых транскриптов
| |
| * [[RefSeq]] [http://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release] − Датасет геномные, транскрипторных и аминокислотных последовательностей
| |
|
| |
| ===Базы данных последовательности белков===
| |
| * [[PIR]] [http://proteininformationresource.org] − Ресурсы для помощи в интеграции протеомных и геномных данных, а также для стандартизации аннотаций белка
| |
| * [[UniProtKB]] [http://uniprot.org] − База данных по аминокислотным последовательностям и функционалу белков
| |
|
| |
| ===Базы данных 3D структур===
| |
| * [[CCDC]] [http://ccdc.cam.ac.uk] − База данных кристаллических структур малых молекул
| |
| * [[EMDB]] [http://ebi.ac.uk/pdbe/emdb] − Репозиторий электронномикроскопических изображений макромолекулярных комплексов и субклеточных структур
| |
| * [[PDB]] [http://rcsb.org] − База трехмерных структурных данных белков и нуклеиновых кислот
| |
|
| |
| ===Базы данных химических соединений===
| |
| * [[CAS]] [http://cas.org] − База данных химических веществ
| |
| * [[CSDB]] [http://csdb.glycoscience.ru/database] − База данных углеводных структур, таксономий,библиографии, ЯМР данными
| |
| * [[PubChem]] [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov] − База данных структуры и активности химических структур
| |
| * [[Reaxys]] − Химический каталог выделенных соединений, фактов о них, информации о реакциях и синтезе
| |
|
| |
| ===Базы данных геномов и аннотаций===
| |
| * [[Ensembl]] [http://ensembl.org] − Автоматически аннотируемые базы данных для генома человека и геномов других видов
| |
| * [[NCBI_Genome]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/genome] − Геномная база данных
| |
| * [[UCSC_Genome_Browser]] [http://genome.ucsc.edu] − Браузер человеческого генома
| |
|
| |
| ===Базы данных вариаций генома===
| |
| * [[ClinVar]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/clinvar] − Агрегатор информации о генетических вариациях и их влияниях на здоровье человека
| |
| * [[DbSNP]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/snp] − База данных однонуклеотидных полиморфизмов ([[SNP]])
| |
| * [[DbVar]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/dbvar] − База данных геномных вариаций человека - вставок, делеций, инверсий, мобильных элементов и транслокаций
| |
| * [[OMIM]] [http://omim.org] − Каталог человеческих генов и генетических расстройств
| |
|
| |
| ===Базы данных геном-фенотип===
| |
| * [[DbGaP]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/gap] − Данные из исследований взаимосвязей генотипов и фенотипов у людей
| |
| * [[ICGC]] [http://dcc.icgc.org] − Наборы данных по онкогеномике
| |
|
| |
| ===Базы данных взаимодействий===
| |
| * [[DrugBank]] [http://go.drugbank.com] − База данных, содержащая информацию о лекарствах и лекарственных мишенях
| |
| * [[Kalium]] [http://kaliumdb.org] − База данных по полипептидным лигандам калиевых каналов
| |
| * [[MINT]] [http://mint.bio.uniroma2.it] − Данные о функциональных взаимодействиях белков между собой
| |
| * [[STRING]] [http://string-db.org] − База данных для известных и предсказываемых белок-белковых взаимодействий
| |
|
| |
| ===Базы данных сигнальных путей===
| |
| * [[KEGG]] [http://kegg.jp] − Коллекция баз данных о геномах, биологических путей, болезней, лекарств и химических веществ
| |
| * [[Reactome]] [http://reactome.org] − База данных биологических путей
| |
| * [[WikiPathways]] [http://wikipathways.org] − Вики, посвященная биологическим путям
| |
|
| |
| ===Базы данных секвенирования===
| |
| * [[SRA]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/sra] − База данных высокопроизводительного секвенирования
| |
|
| |
| ===Базы данных заболеваний и меицинской информации===
| |
| * [[ClinicalTrials]] [http://clinicaltrials.gov] − База данных частно и публично финансируемых клинических исследованиях
| |
| * [[Pharma_Intelligence]] − Данные о мировых исследованиях и разработках (R&D) в области фармакологии
| |
|
| |
| ===Базы данных по экспрессии генов/гистологии===
| |
| * [[Expression_Atlas]] [http://ebi.ac.uk/gxa/home] − База данных генов и белковой экспресии
| |
| * [[Human_Protein_Atlas]] [http://proteinatlas.org] − Шведская база данных максимального числа известных белков человеческого организма с распределением по клеткам, тканям и органам
| |
|
| |
| ===Базы данных по таксономии===
| |
| * [[NCBI_Taxonomy_Browser]] [http://ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi] − База данных по таксономиям
| |
|
| |
| ===Поисковые движки по биологическим базам данных===
| |
| * [[Expasy]] [http://expasy.org] − Портал для биологических баз данных и инструментов
| |
| <br>
| |
| * '''[[Список биологических баз данных|Полный список биологических баз данных]]'''
| |
|
| |
|
| == Журналы, публикующие обзоры по ББД == | | == Журналы, публикующие обзоры по ББД == |
Строка 93: |
Строка 12: |
| == Ссылки == | | == Ссылки == |
| * [https://youtube.com/watch?v=a1Cyu7xwiVg Лекция про ББД в курсе "Введение в биоинформатику", МГУ] | | * [https://youtube.com/watch?v=a1Cyu7xwiVg Лекция про ББД в курсе "Введение в биоинформатику", МГУ] |
|
| |
| [[Список биологических баз данных|Полный список биологических баз данных]]
| |