Редактирование:
FOXO3B
(раздел)
Перейти к навигации
Перейти к поиску
Внимание:
Вы не вошли в систему. Ваш IP-адрес будет общедоступен, если вы запишете какие-либо изменения. Если вы
войдёте
или
создадите учётную запись
, её имя будет использоваться вместо IP-адреса, наряду с другими преимуществами.
Анти-спам проверка.
Не
заполняйте это!
==Publications== {{medline-entry |title=Genetic investigation of FOXO3A requires special attention due to sequence homology with [[FOXO3B]]. |pubmed-url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22588664 |abstract=Our study demonstrates that the genetic investigation of forkhead box O3A gene (FOXO3A), a validated human longevity gene, is greatly hampered by the fact that its exonic regions have 99% sequence homology with the [[FOXO3B]] pseudogene. If unaccounted for, this high degree of homology can cause serious genotyping or sequencing errors. Here, we present an experimental set-up that allows reliable data generation for the highly homologous regions and that can be used for the evaluation of assay specificity. Using this design, we exemplarily showed FOXO3A-specific results for two single-nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs4945816 and rs4946936) that are significantly associated with longevity in our centenarian-control sample (P(each)=0.0008). Because both SNPs are located in the 3' untranslated region of FOXO3A, they could be of functional relevance for the longevity phenotype. Our experimental set-up can be used for reliable and reproducible data generation for further sequencing and genotyping studies of FOXO3A with the aim of discovering new SNPs of functional relevance. |mesh-terms=* Forkhead Box Protein O3 * Forkhead Transcription Factors * Genotype * Humans * Longevity * Phenotype * Polymorphism, Single Nucleotide * Pseudogenes * Sequence Homology |full-text-url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3548564 }} {{medline-entry |title=FOXO3 gene variants and human aging: coding variants may not be key players. |pubmed-url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22459618 |abstract=FOXO3 is generally recognized as a "master" gene in aging since its association with longevity has been replicated in multiple organisms and human populations. A group of single nucleotide polymorphisms in linkage disequilibrium with a coding region has been associated with human longevity, but the actual functional variant is unidentified. Therefore, we sequenced the coding region in our long-lived Japanese American population in order to enhance resources for fine mapping this region. We demonstrate that of 38 published variants, 6 are misalignments with homologous nonallelic sequences from [[FOXO3B]] ([[ZNF286B]]), a pseudogene on a different chromosome; 2 are attributable to [[ZNF286B]] only, and the remaining 30 were unconfirmed, indicating that they are very rare and not likely involved in longevity. Furthermore, we identified a novel, unique, nonsynonymous coding variant in exon 3 (Gly566Ala; rs138174682) that is prevalent in multiple ethnic groups but appeared too rare for major longevity effects in our study populations. |mesh-terms=* Aged * Aged, 80 and over * Aging * Alleles * Asian Americans * Case-Control Studies * Chromosome Mapping * Cohort Studies * European Continental Ancestry Group * Female * Forkhead Box Protein O3 * Forkhead Transcription Factors * Genetic Variation * Humans * Longevity * Male * Middle Aged * Open Reading Frames * Polymorphism, Single Nucleotide * Sensitivity and Specificity |full-text-url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3668389 }}
Описание изменений:
Пожалуйста, учтите, что любой ваш вклад в проект «hpluswiki» может быть отредактирован или удалён другими участниками. Если вы не хотите, чтобы кто-либо изменял ваши тексты, не помещайте их сюда.
Вы также подтверждаете, что являетесь автором вносимых дополнений, или скопировали их из источника, допускающего свободное распространение и изменение своего содержимого (см.
Hpluswiki:Авторские права
).
НЕ РАЗМЕЩАЙТЕ БЕЗ РАЗРЕШЕНИЯ ОХРАНЯЕМЫЕ АВТОРСКИМ ПРАВОМ МАТЕРИАЛЫ!
Отменить
Справка по редактированию
(в новом окне)
Навигация
Персональные инструменты
Вы не представились системе
Обсуждение
Вклад
Создать учётную запись
Войти
Пространства имён
Статья
Обсуждение
русский
Просмотры
Читать
Править
История
Ещё
Навигация
Начало
Свежие правки
Случайная страница
Инструменты
Ссылки сюда
Связанные правки
Служебные страницы
Сведения о странице
Дополнительно
Как редактировать
Вики-разметка
Telegram
Вконтакте
backup