Редактирование:
FOSL1
(раздел)
Перейти к навигации
Перейти к поиску
Внимание:
Вы не вошли в систему. Ваш IP-адрес будет общедоступен, если вы запишете какие-либо изменения. Если вы
войдёте
или
создадите учётную запись
, её имя будет использоваться вместо IP-адреса, наряду с другими преимуществами.
Анти-спам проверка.
Не
заполняйте это!
==Publications== {{medline-entry |title=RNA-Seq analysis reveals new evidence for inflammation-related changes in aged kidney. |pubmed-url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27153548 |abstract=Age-related dysregulated inflammation plays an essential role as a major risk factor underlying the pathophysiological aging process. To better understand how inflammatory processes are related to aging at the molecular level, we sequenced the transcriptome of young and aged rat kidney using RNA-Seq to detect known genes, novel genes, and alternative splicing events that are differentially expressed. By comparing young (6 months of age) and old (25 months of age) rats, we detected 722 up-regulated genes and 111 down-regulated genes. In the aged rats, we found 32 novel genes and 107 alternatively spliced genes. Notably, 6.6% of the up-regulated genes were related to inflammation (P < 2.2 × 10-16, Fisher exact t-test); 15.6% were novel genes with functional protein domains (P = 1.4 × 10-5); and 6.5% were genes showing alternative splicing events (P = 3.3 × 10-4). Based on the results of pathway analysis, we detected the involvement of inflammation-related pathways such as cytokines (P = 4.4 × 10-16), which were found up-regulated in the aged rats. Furthermore, an up-regulated inflammatory gene analysis identified the involvement of transcription factors, such as [[STAT4]], [[EGR1]], and [[FOSL1]], which regulate cancer as well as inflammation in aging processes. Thus, RNA changes in these pathways support their involvement in the pro-inflammatory status during aging. We propose that whole RNA-Seq is a useful tool to identify novel genes and alternative splicing events by documenting broadly implicated inflammation-related genes involved in aging processes. |mesh-terms=* Aging * Alternative Splicing * Animals * Biomarkers * Down-Regulation * Early Growth Response Protein 1 * Feasibility Studies * Gene Expression Profiling * Inflammation * Kidney * Male * Proto-Oncogene Proteins c-fos * RNA * Rats * Rats, Sprague-Dawley * STAT4 Transcription Factor * Sequence Analysis, RNA * Signal Transduction * Specific Pathogen-Free Organisms * Transcriptome * Up-Regulation |keywords=* Gerotarget * RNA-Seq * aging * alternative splicing * differentially expressed genes * inflammation * novel genes |full-text-url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5058662 }}
Описание изменений:
Пожалуйста, учтите, что любой ваш вклад в проект «hpluswiki» может быть отредактирован или удалён другими участниками. Если вы не хотите, чтобы кто-либо изменял ваши тексты, не помещайте их сюда.
Вы также подтверждаете, что являетесь автором вносимых дополнений, или скопировали их из источника, допускающего свободное распространение и изменение своего содержимого (см.
Hpluswiki:Авторские права
).
НЕ РАЗМЕЩАЙТЕ БЕЗ РАЗРЕШЕНИЯ ОХРАНЯЕМЫЕ АВТОРСКИМ ПРАВОМ МАТЕРИАЛЫ!
Отменить
Справка по редактированию
(в новом окне)
Навигация
Персональные инструменты
Вы не представились системе
Обсуждение
Вклад
Создать учётную запись
Войти
Пространства имён
Статья
Обсуждение
русский
Просмотры
Читать
Править
История
Ещё
Навигация
Начало
Свежие правки
Случайная страница
Инструменты
Ссылки сюда
Связанные правки
Служебные страницы
Сведения о странице
Дополнительно
Как редактировать
Вики-разметка
Telegram
Вконтакте
backup