Открыть главное меню
Главная
Случайная
Войти
Настройки
О hpluswiki
Отказ от ответственности
hpluswiki
Найти
Редактирование:
SOX13
Внимание:
Вы не вошли в систему. Ваш IP-адрес будет общедоступен, если вы запишете какие-либо изменения. Если вы
войдёте
или
создадите учётную запись
, её имя будет использоваться вместо IP-адреса, наряду с другими преимуществами.
Анти-спам проверка.
Не
заполняйте это!
Transcription factor SOX-13 (Islet cell antigen 12) (SRY (Sex determining region Y)-box 13) (Type 1 diabetes autoantigen ICA12) ==Publications== {{medline-entry |title=In silico analysis of human renin gene-gene interactions and neighborhood topologically associated domains suggests breakdown of insulators contribute to ageing-associated diseases. |pubmed-url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31520345 |abstract=Three-dimensional chromatin architecture and gene-gene interactions impact gene expression. We assembled this information, in silico, for the human renin gene ([[REN]]). We searched for chromatin contacts and boundaries and the locations of super-enhancers that are involved in cell specific differentiation. The [[REN]] promoter was connected via RNA polymerase II binding to promoters of 12 neighboring genes on chromosome 1q32.1 over a distance of 762,497 bp. This constitutes a regulatory archipelago. The genes formed 3 topologically associated domains (TADs), as follows: TAD1: [[ZC3H11A]], [[SNRPE]], LINC00303; [[SOX13]]; TAD2: [[ETNK2]], [[REN]], [[KISS1]], GOLT1A; TAD3: [[PLEKHA6]], LINC00628, [[PPP1R15B]], [[PIK3C2B]], [[MDM4]]. [[REN]] in TAD2, was isolated from its neighboring genes in TAD1 and TAD3 by [[CTCF]]-binding sites that serve as insulators. TAD1 and TAD3 genes [[SOX13]] and LINC00628 overlapped super-enhancers, known to reside near nodes regulating cell identity, and were co-expressed in various tissues, suggesting co-regulation. [[REN]] was also connected with 62 distant genes genome-wide, including the angiotensin II type 1 receptor gene. The findings lead us to invoke the following novel hypothesis. While the [[REN]] promoter is isolated from neighboring super-enhancers in most cells by insulators, these insulators break down with cell age to permit the inappropriate expression of [[REN]] in non-kidney cells by using the neighboring super-enhancers, resulting in expression in a wider spectrum of tissues, contributing to aging-related immune system dysregulation, cardiovascular diseases and cancers. Research is needed to confirm this hypothesis experimentally. |mesh-terms=* Aging * Computer Simulation * Epistasis, Genetic * Humans * Promoter Regions, Genetic * Renin |keywords=* Aging * Diseases of aging * Gene expression * Gene–gene interaction * Genomics * Longevity * Renin-angiotensin system * Topologically associated domains |full-text-url=https://sci-hub.do/10.1007/s10522-019-09834-1 }}
Описание изменений:
Пожалуйста, учтите, что любой ваш вклад в проект «hpluswiki» может быть отредактирован или удалён другими участниками. Если вы не хотите, чтобы кто-либо изменял ваши тексты, не помещайте их сюда.
Вы также подтверждаете, что являетесь автором вносимых дополнений, или скопировали их из источника, допускающего свободное распространение и изменение своего содержимого (см.
Hpluswiki:Авторские права
).
НЕ РАЗМЕЩАЙТЕ БЕЗ РАЗРЕШЕНИЯ ОХРАНЯЕМЫЕ АВТОРСКИМ ПРАВОМ МАТЕРИАЛЫ!
Отменить
Справка по редактированию
(в новом окне)
Шаблон, используемый на этой странице:
Шаблон:Medline-entry
(
править
)