AlphaFold: различия между версиями

Материал из hpluswiki
Перейти к навигации Перейти к поиску
(Новая страница: «Проект [https://deepmind.com/research/case-studies/alphafold AlphaFold] создан компанией [https://deepmind.com/ DeepMind] и позволяе...»)
 
мНет описания правки
 
(не показано 11 промежуточных версий этого же участника)
Строка 1: Строка 1:
Проект [https://deepmind.com/research/case-studies/alphafold AlphaFold] создан компанией [https://deepmind.com/ DeepMind] и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка. Этот проект открывает новые перспективы для [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D1%8F_%D0%B8%D0%BD%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%80%D0%B8%D1%8F белковой инженерии], так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно. Эта проблема называется [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A4%D0%BE%D0%BB%D0%B4%D0%B8%D0%BD%D0%B3_%D0%B1%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%B0 фолдингом белка].
Проект [https://deepmind.com/research/case-studies/alphafold AlphaFold] создан компанией [https://deepmind.com/ DeepMind] и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка.


[[Файл:Https://github.com/Urinx/alphafold pytorch/raw/master/test out/T1019s2.png|мини|Иллюстрация работы AlphaFold из версии для PyTorch]]
AlphaFold открывает новые перспективы для [[белковая инженерия|белковой инженерии]], так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно.
Эта проблема называется [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A4%D0%BE%D0%BB%D0%B4%D0%B8%D0%BD%D0%B3_%D0%B1%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%B0 фолдингом белка].
 
== История ==
 
* Декабрь 2018, победа AlphaFold на [https://en.wikipedia.org/wiki/CASP CASP]
* Ноябрь 2020, AlphaFold 2 снова побеждает на [https://en.wikipedia.org/wiki/CASP CASP]
 
{{
  Комментарий
  | текст=Необходимо описать «[https://predictioncenter.org/ CASP]», но как описать серию экспериментов, проходящую из года в год, в которой есть победители и проигравшие?
  | автор=Experimentalist
}}


== Ссылки ==
== Ссылки ==


Реализация [https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch Alphafold на PyTorch].
* Реализация [https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch Alphafold на PyTorch]
* [https://github.com/hypnopump/MiniFold MiniFold], альтернативная реализация алгоритма AlphaFold от Eric Alcaide на [https://www.tensorflow.org/ TensorFlow] и [https://keras.io/ Keras]; [https://zenodo.org/record/3774491 страница] на [[Zenodo]]
 
[[Category:Белковая инженерия]]
[[Category:Системы глубокого обучения]]
[[Category:Программы]]
[[Category:Открытое ПО]]
[[Category:Незавершённые статьи]]

Текущая версия от 19:14, 22 февраля 2021

Проект AlphaFold создан компанией DeepMind и позволяет предсказать трёхмерную структуру белка.

AlphaFold открывает новые перспективы для белковой инженерии, так как предсказать форму белка, то, как он свернётся после синтеза рибосомой, очень сложно. Эта проблема называется фолдингом белка.

История[править]

  • Декабрь 2018, победа AlphaFold на CASP
  • Ноябрь 2020, AlphaFold 2 снова побеждает на CASP


Комментарий

Необходимо описать «CASP», но как описать серию экспериментов, проходящую из года в год, в которой есть победители и проигравшие?

Experimentalist


Ссылки[править]