Формат: различия между версиями

← Предыдущая правка

Формат (править)

Версия от 10:00, 22 февраля 2021

7927 байт добавлено , 22 февраля 2021

→‎Взаимодействие белков

Experimentalist

Администраторы, Редакторы

684

правки

@@ Строка 3: / Строка 3: @@
 Давайте зададимся вопросом: «что мы хотим донести этой Вики?».
+==Возможные функции вики==
+Для вики не стоит определять единую цель и функцию, т.к. вики создает множество авторов с разным бэкграундом, интересами, а подчас и с явно конфликтующими и противоположными точками зрения на предмет. Можно лишь наметить спектр возможных функций. Например:
+''(Для кого и что)''
+* '''Ученые:''' Площадка для коммуникации между исследователями в релевантных трансгуманизму направлениях науки и техники.
+* '''Студенты:''' Ресурс, аккумулирующий образовательные материалы и просвещающий насчет хороших способов получить знания/образование и стать тем, кем хочешь стать.
+* '''Трансгуманисты в целом:''' Информация о персоналиях, компаниях и проектах ставящих перед собой трансгуманистические цели.
+* '''Биохакеры:''' Информация об имеющихся знаниях по улучшению физических и ментальных кондиций с помощью употребления БАДов и корректировки образа жизни.
+* '''True биохакеры:''' Информация о биохакерспейсах, открытых лабораториях, доступном инструментарии и препаратах
+* '''Самовычисляторы:''' Информация о существующих инструментах и сервисах в области Quantified Self
+== Предложения==
 === Предложение 1 - показать требуемый прогресс технологий ===
@@ Строка 10: / Строка 22: @@
 Нам нужна теоретическая информация. Для того, чтобы иметь цельный ответ на вопрос "как продлить жизнь?" нужно много тысяч ответов на другие вопросы. Более того, есть много идей о том, как продлить жизнь, которые могут просто стать частью медицины в будущем. Например:
+* "Как пережить наступление новых болезней?"
 * "Насколько можно улучшить эффективность мышления и качество жизни сейчас?"
 * "Какие меры следует предпринимать для того, чтобы прожить дольше?"
@@ Строка 34: / Строка 47: @@
 Чтобы обсуждать что-то со специалистами в нейробиологии, нам нужна карта мозга. Здесь нам повезло - есть проект [https://brainder.org/gallery/ Brainder]. Мы можем [https://brainder.org/research/brain-for-blender/ загрузить] отдельные модели, у каждой есть части, которые можно выбрать и просмотреть отдельно. Тогда дело останется за тем, чтобы сделать интерфейс из двух главных элементов. Описание отдела мозга, его функций и ссылок на научные публикации слева. Трёхмерная модель с [https://threejs.org/examples/#webgl_animation_cloth функцией вращения камеры] и [https://threejs.org/examples/#webgl_camera_cinematic выбора отделов] справа.
+==== 2.2 - карта тела ====
+Пока для общения со специалистами мы обойдёмся [https://www.zygotebody.com/ Zygote Body Explorer].
+Здесь есть явная проблема, лицензия. Zygote [https://www.zygote.com/ продаёт] эти модели за деньги.
+Также у нас будут вопросы, может ли специалист делать снимки экрана в статью или множество других подобных.
+В итоге есть два выхода. 1 - купить эти модели. 2 - посмотреть, как обрабатывал модели проект Brainder и можно ли сделать из публичных или запрошенных снимков внутренностей внятную трёхмерную модель для обсуждений.
+{{Запрос экспертизы
+|text=Нужно понимание того, могут ли нам подарить МРТ-снимки и другие объёмные снимки и можно ли их использовать. Насчёт второго у меня есть догадка - [https://acko.net/blog/this-is-your-brain-on-css/ можно]. Кого можно спросить насчёт полного 3D-скана тела без слишком запрещающей лицензии? Что-то вроде Creative Commons - отлично.
+|qualification=Пациент МРТ и других медицинских томографов, гик
+}}
+Статья:[[Анатомические визуализации]]
+==== 2.3 - карта клетки ====
+Здесь я не знаю, как поступить. В принципе, можно перерисовать модели.
+Я думаю о моделях в стиле «[https://www.youtube.com/watch?v=wJyUtbn0O5Y The Inner Life of the Cell]».
+Как минимум, той их части, которая не относится к белкам
+{{
+  Запрос экспертизы
+  | text=Нужно понимание того, какие трёхмерные модели и с какой детальностью нужны для обсуждения функций клетки.
+  | qualification=Биолог, цитобиолог
+}}
+==== 2.4 - карта белков ====
+Для белков существует штатный формат: [https://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank#File_format PDB] (protein database).
+Нужно ли нам нечто помимо Wiki-шаблонов - другой вопрос.
+===== Взаимодействие белков =====
+Есть множество видео и публикаций, где большой труд потрачен на визуализацию взаимодействия белков между собой.
+Я ума не приложу, есть ли аналог PDB для таких анимаций и что с этим делать.
+* https://www.youtube.com/watch?v=7Hk9jct2ozY
+* https://www.youtube.com/watch?v=X_tYrnv_o6A
+* https://www.youtube.com/watch?v=WFCvkkDSfIU
+* https://www.youtube.com/watch?v=LQmTKxI4Wn4
+Статья: [[Визуализация внутриклеточных процессов]]
+{{
+  Запрос экспертизы
+  | text=Мы ещё не знаем, что нам нужно и нужно ли показывать взаимодействие белков. Нужны советы и идеи.
+  | qualification=Биолог
+}}
+==== 2.5 - дерево дифференциации клеток ====
+Для логической связки и упорядочивания в сознании исследователя отдельных сюжетов внутриклеточной и межклеточной жизни, хорошо представлять, в каких типах клеток они случаются. А клетки лучше всего типизировать по линиям их развития, начиная с самой первой клетки организма - зиготы.
+==== 2.6 - химия ====
+Скорее всего, от неё мы никуда не убежим, хотя какие разделы химии нам понадобятся мы узнаем в процессе.
+==== 2.7 - электроника ====
+===== Модели in-silico =====
+Пока можно просто описать существующие в виде краткого текста - задача, функции, основа (fpga, vlsi).
+=== Предложение 3 - решение задач по презентации контента инструментами MediaWiki ===
+Предлагаю (denis.s) двигаться от простого к сложному:
+# Вначале создавать информационную структуру простыми средствами MediaWiki - текстом, списками, ссылками
+# При накоплении объема текста, ставшего сложным для восприятия, сжимать информацию инфографическими средствами:
+#* созданием таблиц
+#* созданием шаблонных плашек
+#* картированием описываемых сущностей на человеческом теле и органах
+— Так оно и работает (Experimentalist). Материал без ссылки легко будет создать только вокруг мозга. Плюс шаблонов в том, что их будет легче извлечь в свой аналог [https://www.wikidata.org/ Викиданных] для инфографики.